2011年2月20日17点18分，随着最后一片网架的“到位”，南京南站正式封顶。中建南京南站项目部表示，这意味着南京南站项目已进入尾项工程。此外，确保在5月底之前完成站房的装修，移交给京沪高铁，纳入整个联调联试。据介绍，初步计划为5月中旬投入试运营，6月中旬投入使用。
据建设方的工作人员介绍，项目的创新点在于地源热泵＋太阳能顶，自动翻窗会换气。
记者在现场看到，“太阳能屋顶”已经铺好。据介绍，该系统将于今年6月份与南站同步建成投入使用，这也是目前世界上最大的光伏建筑一体化（BIPV）项目。
南站站房屋顶（含两侧无站台柱雨棚）上，铺设了近8万平方米太阳能电池板。工程技术人员表示，这个电池板及站房内发电设备是一个设计容量10兆瓦的太阳能发电系统，如果按平均每天每户用电量2千瓦时计算，每天屋顶所发电量可以满足1.2万户家庭用电。
除此之外，南京南站还采用了地源热泵给地板采暖、自动翻窗自动换气、雨水通过虹吸技术循环使用等。“很多人觉得候车室空气不流通，南京南站则不会。”骆明红称，“只要摁下控制按钮，窗户就打开了，具备自动换气功能。”